เปปไทด์ที่เจาะเซลล์คืออะไร?

เปปไทด์ที่เจาะเซลล์เป็นเปปไทด์ขนาดเล็กที่สามารถเจาะเยื่อหุ้มเซลล์ได้ง่ายโมเลกุลประเภทนี้ โดยเฉพาะ CPP ที่มีฟังก์ชันการกำหนดเป้าหมาย ถือเป็นคำมั่นสัญญาว่าจะส่งยาอย่างมีประสิทธิภาพไปยังเซลล์เป้าหมาย

ดังนั้นการวิจัยจึงมีความสำคัญทางชีวการแพทย์บางประการในการศึกษานี้ มีการศึกษา CPP ที่มีกิจกรรมของเมมเบรนต่างกันในระดับลำดับ โดยพยายามค้นหาปัจจัยที่ส่งผลต่อกิจกรรมของเมมเบรนของ CPP ความแตกต่างของลำดับระหว่าง CPP ที่มีกิจกรรมต่างกันกับ NonCPP และแนะนำวิธีการวิเคราะห์ลำดับทางชีววิทยา

ลำดับ CPP และ NonCPP ได้มาจากฐานข้อมูล CPPsite และวรรณกรรมที่แตกต่างกัน และเมมเบรนเปปไทด์ (HCPPs, MCPPs, LCPPs) ที่มีกิจกรรมเมมเบรนสูง ปานกลาง และต่ำถูกแยกออกจากลำดับ CPP เพื่อสร้างชุดข้อมูลจากชุดข้อมูลเหล่านี้ มีการศึกษาต่อไปนี้:

1 วิเคราะห์องค์ประกอบกรดอะมิโนและโครงสร้างทุติยภูมิของ CPP ที่ใช้งานอยู่และ NonCPP ที่แตกต่างกันโดย ANOVAพบว่าปฏิกิริยาระหว่างไฟฟ้าสถิตและไม่ชอบน้ำของกรดอะมิโนมีบทบาทสำคัญในกิจกรรมของเมมเบรนของ CPP และโครงสร้างขดลวดและการขดแบบสุ่มก็ส่งผลต่อกิจกรรมของเมมเบรนของ CPP ด้วย

2. คุณสมบัติทางกายภาพและเคมีและความยาวของ CPP ที่มีกิจกรรมต่างกันถูกแสดงบนระนาบสองมิติพบว่า CPP และ NonCPP ที่มีกิจกรรมต่างกันสามารถจัดกลุ่มภายใต้คุณสมบัติพิเศษบางประการได้ และ HCPP, MCPPs, LCPPs และ NonCPPs ถูกแบ่งออกเป็นสามกลุ่ม ซึ่งแสดงให้เห็นความแตกต่าง

3. ในบทความนี้ เราจะนำแนวคิดเรื่องเซนทรอยด์ทางกายภาพและเคมีของลำดับทางชีววิทยามาใช้ และสารตกค้างที่ประกอบเป็นลำดับจะถือเป็นจุดอนุภาค และลำดับดังกล่าวจะถูกสรุปเป็นระบบอนุภาคสำหรับการวิจัยวิธีการนี้นำไปใช้กับการวิเคราะห์ CPP โดยการฉาย CPP ที่มีกิจกรรมที่แตกต่างกันบนระนาบ 3 มิติโดยวิธี PCA และพบว่า CPP ส่วนใหญ่รวมกลุ่มเข้าด้วยกัน และ LCPP บางส่วนรวมกลุ่มร่วมกับ NonCPP

การศึกษานี้มีผลกระทบต่อการออกแบบ CPP และการทำความเข้าใจความแตกต่างในลำดับของ CPP ที่มีกิจกรรมที่แตกต่างกันนอกจากนี้ วิธีการวิเคราะห์เซนทรอยด์ทางกายภาพและเคมีของลำดับทางชีววิทยาที่แนะนำในบทความนี้ยังสามารถนำไปใช้ในการวิเคราะห์ปัญหาทางชีววิทยาอื่นๆ ได้อีกด้วยในเวลาเดียวกันสามารถใช้เป็นพารามิเตอร์อินพุตสำหรับปัญหาการจำแนกประเภททางชีววิทยาและมีบทบาทในการจดจำรูปแบบ